Desde el tercer milenio a. C., la civilización del Indo tuvo extensos centros urbanos, como Harappa y Mohenjo-daro, con medidas estandarizadas, artesanías y gestión del agua. La escritura del Indo aún no ha sido descifrada y se desconocen la organización política y la lengua de estas comunidades. Más tarde, la región formó parte de diversos poderes e imperios regionales, desde la influencia aqueménida y maurya hasta Gandhara, en la encrucijada de los vínculos entre el sur y el centro de Asia.
A partir del siglo VII, las conquistas y el comercio islámicos trajeron nuevas redes políticas, mientras que las lenguas y tradiciones locales continuaron. Los sultanatos de Delhi y el dominio mogol abarcaron distintas partes del actual Pakistán; las redes sufíes, las artesanías urbanas y el persa como lengua administrativa influyeron en la vida cultural. Punyab, Sind, Baluchistán y las regiones septentrionales siguieron, no obstante, trayectorias distintas, de modo que la historia dinástica no equivale a una única cultura regional uniforme.
El dominio colonial británico transformó la agricultura, los ferrocarriles y las fronteras administrativas y puso fin a muchas estructuras políticas antiguas. La partición de la India británica en 1947 provocó migraciones y violencia masivas, y Pakistán se creó con dos territorios, occidental y oriental; Bangladés se independizó en 1971 tras una guerra y una crisis política. Desde entonces se han alternado gobiernos militares y civiles. La lengua, la autonomía provincial y el equilibrio entre identidades religiosas, regionales y nacionales siguen siendo cuestiones importantes.